|
Analýza EEG signálu pomocí analýzy hlavních komponent (PCA)
Walczysko, Martin ; Vítek, Martin (oponent) ; Rychtárik, Milan (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá měřením EEG v laboratoři UBMI FEKT BRNO a jeho následným zpracováním v programovém prostředí Matlab. Cílem je prozkoumat možnosti využití analýzy hlavních komponent k analýze EEG dat. Práce se zabývá možnostmi redukce dimenze vstupních dat v závislosti na rozmístění elektrod, délce natáčení, případně vyskytujícím se artefaktu. Jsou zkoumány také možnosti zvýraznění abnormalit v EEG za účelem snadnější detekce. V závěru jsou probrány možnosti využití ICA k analýze EEG případně k odstranění nežádoucích grafoelementů.
|
|
Vizualizace spektroskopických dat pomocí metody analýzy hlavních komponent
Šrenk, David ; Žák, Libor (oponent) ; Pořízka, Pavel (vedoucí práce)
Diplomová práce se věnuje spektroskopií laserem buzeného plazmatu k určování prvkového složení neznámých vzorků. Bylo nutné navrhnout vhodnou metodu pro kvalifikaci materiálu pomocí emisních spekter indukovaných laserem. Pro kvalifikaci prvkového složení bylo nezbytné použít různé chemometrické metody a předzpracování dat. Kýžené kvalifikace jsme dosáhli projekcí dat do nového PCA prostoru, následného vytvoření shluků a vyměření Euklidovských vzdáleností jednotlivých shluků mezi sebou. Experiment v praktické části byl nastaven na detekci rozhraní dvou prvků. Vytvořili jsme tedy datový soubor simulující ablaci na rozhraní. Tento datový soubor byl postupně zpracován matematicko-chemicko-fyzikálním pohledem. Bylo zpracováno několik postupů pro analýzu dat: aproximace pomocí Lorenzovy, Gaussovy a Voigtovy funkce a také metody předzpracování, jako detekce odlehlých bodů, standardizace dat různými způsoby a následné použití metody hlavních komponent. V práci je zaznamenán soubor shrnutí postupů pro kvalifikaci vstupních dat.
|
|
Analýza složení samčího sexuálního feromonu různých populací tropické ovocné mušky Ceratitis capitata (Diptera, Tephritidae)
Ježková, Zuzana ; Bosáková, Zuzana (vedoucí práce) ; Jirošová, Anna (oponent)
Ceratitis capitata je významný zemědělský škůdce, jehož reprodukční chování je kontrolováno chemickými signály. Samečci zahajují páření tvorbou rojů, v kterých uvolňují sexuální feromony, jimiž lákají samičky k páření. Cílem diplomové práce bylo zjištění vlivu hostitelských rostlin na složení samčích sexuálních feromonů C. capitata. Bylo studováno chemické složení těkavých látek uvolňovaných volajícími samci C. capitata z jedné laboratorní a dvou divokých populací pomocí dvourozměrné plynové chromatografie s průletovým analyzátorem a hmotnostní spektrometrickou detekcí (GC×GC- TOFMS), plynové chromatografie s elektroantenografickou a plamenově ionizační detekcí (GC-EAD-FID) a analýzy vícerozměrných dat. Byly zjištěny významné rozdíly v kvantitativním a kvalitativním složení chemických látek uvolňovaných samci zkoumaných populací. Analýzy z GC-EAD-FID odhalily čtrnáct antenálně aktivních látek s možnými behaviorálními funkcemi. Jako antenálně aktivní látky C. capitata byly poprvé zaznamenány isomenthon, geraniol, bornylacetát, geranylaceton a ethyloktanoát. Statistické analýzy ukázaly srovnatelnou citlivost tykadel samečků a samiček na hlavní komponenty samčích emanací. Celkově jsou tyto výsledky významné z hlediska optimalizace metod kontroly populací C. capitata. klíčová slova: Ceratitis capitata,...
|
|
Chování tří populací myši domácí ( Mus musculus sensu lato) v baterii pěti behaviorálních testů: vliv poddruhové příslušnosti a komensálního způsobu života
Voráčková, Petra ; Frynta, Daniel (vedoucí práce) ; Macholán, Miloš (oponent)
Pojempersonalitase dnesobjevujestále častějivpsychologickýchstudiíchlidí,ale také zvířat. Studiumpersonalitynámpomáhádefinovatjednotlitvérysychování,které se mohoulišitvrámci věku,pohlaví,druhůneboprostředí.Behaviorálnítestysloužíkodhalenítěchtoprvkůchovánía dokážourozdělitzvířatadorůzných variabilníchskupin. Předmětemnašehobádáníse stalytři populace myši domácí(Mus musculussensulato),které jsme otestovali vtestechvolnéexplorace,nucené explorace,hole-boardtestu,testuvertikálníaktivityave vyvýšenémkřížovémbludišti.Testymělyodhalit,zdase tytomyši budoulišitve svémchovánív rámci pohlaví,komenzalismunebopoddruhu. Zjistili jsme(svýjimkoujednohotestu),že ve vnitropopulačnívariabilitějsourozdílyvelmimalé,avšak mezipopulačnírozdílyjsouvlivemkomenzalismuapoddruhovépříslušnosti velkéajasně zřetelné. Klíčováslova:Mus musculus,komenzalismus,openfieldtest,Elevatedplus-maze,Principal ComponentAnanlysis(PCA)
|
|
Využití komprehensivní dvoudimenzionální plynové chromatografie s hmotnostně spektrometrickou detekcí pro metabolomickou analýzu houby Gloeophyllum trabeum
Kuchler, Ondřej ; Sobotníková, Jana (vedoucí práce) ; Kozlík, Petr (oponent)
Houba Gloeophyllum trabeum (Agaricomytes: Gloeophyllates), v českém jazyce známá jako Trámovka trámová, je dřevokazná houba, která produkuje široké spektrum těkavých sekundárních metabolitů. V literatuře bylo popsáno, že jedním z produkovaných sekundárních metabolitů je (3Z,6Z,8E)-dodekatrien-1-ol. Tato chemická látka je zároveň hlavní složkou stopovacího feromonu termitů čeledi Rhinotermitidae. V této diplomové práci jsem ověřoval, zda různé kmeny G. trabeum produkují látku (3Z,6Z,8E)-dodekatrien-1-ol. Dále byl studován vliv sacharidů přítomných v živných roztocích na změnu v kvalitativní a kvantitativní složení těkavých sekundárních metabolitů produkovaných touto houbou. Zvolené sacharidy byly maltóza, fruktóza, sacharóza, xylóza a manóza. Analýza byla prováděna pokročilou separační technikou komprehensivní dvoudimenzionální plynové chromatografie s průletovým analyzátorem a hmotnostně spektrometrickou detekcí (GC×GC-TOFMS). Zjistil jsem, že jeden ze získaných kmenů G. trabeum skutečně produkuje látku (3Z,6Z,8E)-dodekatrien-1-ol, ale pouze za specifických podmínek, tj. při kultivaci na Petriho miskách na agar - celulózovém médiu. Toto měření bylo dále potvrzeno derivatizační reakcí dodekatrienolu se silylačním činidlem N, O-bis(trimethylsilyl) acetamidem (BSA). Pro vzorky G. trabeum kultivované v...
|
|
Využití komprehensivní dvoudimenzionální plynové chromatografie s hmotnostně spektrometrickou detekcí pro metabolomickou analýzu houby Gloeophyllum trabeum
Kuchler, Ondřej ; Sobotníková, Jana (vedoucí práce) ; Kozlík, Petr (oponent)
Houba Gloeophyllum trabeum (Agaricomytes: Gloeophyllates), v českém jazyce známá jako Trámovka trámová, je dřevokazná houba, která produkuje široké spektrum těkavých sekundárních metabolitů. V literatuře bylo popsáno, že jedním z produkovaných sekundárních metabolitů je (3Z,6Z,8E)-dodekatrien-1-ol. Tato chemická látka je zároveň hlavní složkou stopovacího feromonu termitů čeledi Rhinotermitidae. V této diplomové práci jsem ověřoval, zda různé kmeny G. trabeum produkují látku (3Z,6Z,8E)-dodekatrien-1-ol. Dále byl studován vliv sacharidů přítomných v živných roztocích na změnu v kvalitativní a kvantitativní složení těkavých sekundárních metabolitů produkovaných touto houbou. Zvolené sacharidy byly maltóza, fruktóza, sacharóza, xylóza a manóza. Analýza byla prováděna pokročilou separační technikou komprehensivní dvoudimenzionální plynové chromatografie s průletovým analyzátorem a hmotnostně spektrometrickou detekcí (GC×GC-TOFMS). Zjistil jsem, že jeden ze získaných kmenů G. trabeum skutečně produkuje látku (3Z,6Z,8E)-dodekatrien-1-ol, ale pouze za specifických podmínek, tj. při kultivaci na Petriho miskách na agar - celulózovém médiu. Toto měření bylo dále potvrzeno derivatizační reakcí dodekatrienolu se silylačním činidlem N, O-bis(trimethylsilyl) acetamidem (BSA). Pro vzorky G. trabeum kultivované v...
|
|
Vizualizace spektroskopických dat pomocí metody analýzy hlavních komponent
Šrenk, David ; Žák, Libor (oponent) ; Pořízka, Pavel (vedoucí práce)
Diplomová práce se věnuje spektroskopií laserem buzeného plazmatu k určování prvkového složení neznámých vzorků. Bylo nutné navrhnout vhodnou metodu pro kvalifikaci materiálu pomocí emisních spekter indukovaných laserem. Pro kvalifikaci prvkového složení bylo nezbytné použít různé chemometrické metody a předzpracování dat. Kýžené kvalifikace jsme dosáhli projekcí dat do nového PCA prostoru, následného vytvoření shluků a vyměření Euklidovských vzdáleností jednotlivých shluků mezi sebou. Experiment v praktické části byl nastaven na detekci rozhraní dvou prvků. Vytvořili jsme tedy datový soubor simulující ablaci na rozhraní. Tento datový soubor byl postupně zpracován matematicko-chemicko-fyzikálním pohledem. Bylo zpracováno několik postupů pro analýzu dat: aproximace pomocí Lorenzovy, Gaussovy a Voigtovy funkce a také metody předzpracování, jako detekce odlehlých bodů, standardizace dat různými způsoby a následné použití metody hlavních komponent. V práci je zaznamenán soubor shrnutí postupů pro kvalifikaci vstupních dat.
|
|
Chování tří populací myši domácí ( Mus musculus sensu lato) v baterii pěti behaviorálních testů: vliv poddruhové příslušnosti a komensálního způsobu života
Voráčková, Petra ; Frynta, Daniel (vedoucí práce) ; Macholán, Miloš (oponent)
Pojempersonalitase dnesobjevujestále častějivpsychologickýchstudiíchlidí,ale také zvířat. Studiumpersonalitynámpomáhádefinovatjednotlitvérysychování,které se mohoulišitvrámci věku,pohlaví,druhůneboprostředí.Behaviorálnítestysloužíkodhalenítěchtoprvkůchovánía dokážourozdělitzvířatadorůzných variabilníchskupin. Předmětemnašehobádáníse stalytři populace myši domácí(Mus musculussensulato),které jsme otestovali vtestechvolnéexplorace,nucené explorace,hole-boardtestu,testuvertikálníaktivityave vyvýšenémkřížovémbludišti.Testymělyodhalit,zdase tytomyši budoulišitve svémchovánív rámci pohlaví,komenzalismunebopoddruhu. Zjistili jsme(svýjimkoujednohotestu),že ve vnitropopulačnívariabilitějsourozdílyvelmimalé,avšak mezipopulačnírozdílyjsouvlivemkomenzalismuapoddruhovépříslušnosti velkéajasně zřetelné. Klíčováslova:Mus musculus,komenzalismus,openfieldtest,Elevatedplus-maze,Principal ComponentAnanlysis(PCA)
|
|
Hodnocení morfologie patra u BCLP pacientů s palatoláliemi
Hamtilová, Martina ; Velemínská, Jana (vedoucí práce) ; Ivanov, Ilija Christo (oponent)
Diplomová práce byla založena na hodnocení dentálních odlitků pacientů s oboustranným rozštěpem rtu a patra (BCLP) v průměrném věku 10 let. Pacienti tvoří celkem dvě skupiny, a to pacienty bez vady řeči a s vadou řeči (palatolalie). Palatolalie bývají v literatuře spojovány především s velofaryngeální insuficiencí. Studie testuje pracovní hypotézu, že se na poruše řeči podílí také odlišný, nějakým způsobem specifický, tvar patra. Dentální odlitky byly naskenovány prostřednictvím laserového skeneru a analyzovány metodami 3-D geometrické morfometrie a mnohorozměrné statistiky: analýzou hlavních komponent (PCA), lineární regresí a analýzou konečných prvků (FESA). Pomocí lineární regrese bylo zjištěno, že tvar patra je u mladších jedinců ovlivněn věkem, a tak muselo být 5 pacientů pro další analýzy vyřazeno. Pacienti s palatolalií mají nižší variabilitu tvaru patra než pacienti bez palatolalie, jsou si tedy navzájem podobnější a patra mají specifický tvar. Jsou širší a nižší než u jedinců bez poruchy řeči a vykazují charakteristické prohloubení za přední částí patra. Předpokládáme, že právě tyto morfologické znaky, zejména nižší klenutí a výrazné prohloubení, mají s největší pravděpodobností vliv na rozvoj poruchy řeči. Naše výsledky potvrzující pracovní hypotézu bude zapotřebí dále ověřit na širším...
|
|
Analýza složení samčího sexuálního feromonu různých populací tropické ovocné mušky Ceratitis capitata (Diptera, Tephritidae)
Ježková, Zuzana ; Bosáková, Zuzana (vedoucí práce) ; Jirošová, Anna (oponent)
Ceratitis capitata je významný zemědělský škůdce, jehož reprodukční chování je kontrolováno chemickými signály. Samečci zahajují páření tvorbou rojů, v kterých uvolňují sexuální feromony, jimiž lákají samičky k páření. Cílem diplomové práce bylo zjištění vlivu hostitelských rostlin na složení samčích sexuálních feromonů C. capitata. Bylo studováno chemické složení těkavých látek uvolňovaných volajícími samci C. capitata z jedné laboratorní a dvou divokých populací pomocí dvourozměrné plynové chromatografie s průletovým analyzátorem a hmotnostní spektrometrickou detekcí (GC×GC- TOFMS), plynové chromatografie s elektroantenografickou a plamenově ionizační detekcí (GC-EAD-FID) a analýzy vícerozměrných dat. Byly zjištěny významné rozdíly v kvantitativním a kvalitativním složení chemických látek uvolňovaných samci zkoumaných populací. Analýzy z GC-EAD-FID odhalily čtrnáct antenálně aktivních látek s možnými behaviorálními funkcemi. Jako antenálně aktivní látky C. capitata byly poprvé zaznamenány isomenthon, geraniol, bornylacetát, geranylaceton a ethyloktanoát. Statistické analýzy ukázaly srovnatelnou citlivost tykadel samečků a samiček na hlavní komponenty samčích emanací. Celkově jsou tyto výsledky významné z hlediska optimalizace metod kontroly populací C. capitata. klíčová slova: Ceratitis capitata,...
|